DissertationsEnLigne.com - Dissertations gratuites, mémoires, discours et notes de recherche
Recherche

Tp Bioinformatique

Rapports de Stage : Tp Bioinformatique. Rechercher de 53 000+ Dissertation Gratuites et Mémoires
Page 1 sur 5

its, les vrais exons. C'est donc la probabilité de trouver des exons justes. Elle est donnée par la formule suivante : spécificité = Vrais positifs / (Vrais positifs + Faux positifs).

| Genscan | Augustus |

Exons prédits | 16 | 13 |

Transcrits prédits | 1 | 2 |

Sensibilité | 58 | 52 |

Spécificité | 46 | 63 |

Gescan

Exons prédits | Début | Fin | Probabilité |

1 | 5473 | 5532 | 0.576 |

2 | 9705 | 9812 | 0.177 |

3 | 27685 | 27868 | 0.999 |

4 | 30575 | 30706 | 0.663 |

5 | 34820 | 34954 | 0.055 |

6 | 45053 | 45141 | 0.336 |

7 | 55940 | 56007 | 0.140 |

8 | 67271 | 67467 | 0.162 |

9 | 69653 | 69788 | 0.997 |

10 | 70847 | 70916 | 0.975 |

11 | 75652 | 75708 | 0.768 |

12 | 78094 | 78267 | 0.913 |

13 | 78824 | 78957 | 0.984 |

14 | 79989 | 80054 | 0.844 |

15 | 82088 | 82203 | 0.977 |

16 | 85420 | 85467 | 0.018 |

16 exons prédits

Séquence protéique : (592aa) MSTAVLENPGLGRKLSDFGQETSYIEDNCNQNGAISLIFSLKEEVGALAKVLRLFEENDV

NLTHIESRPSRLKKDEYEFFTHLDKRSLPALTNIIKILRHDIGATVHELSRDKKKDTASQ

AASPMTALPCFFPATCSQQELQTLWTKGLPDPGAIQPLVGAARFEFHLTPFQMDDRFSFI

CEMEQRPTLPIPVAHGGDYVEYPVHKVPWFPRTIQELDRFANQILSYGAELDADHPGFKD

PVYRARRKQFADIAYNYRHGQPIPRVEYMEEEKKTWGTVFKTLKSLYKTHACYEYNHIFP

LLEKYCGFHEDNIPQLEDVSQFLQTCTGFRLRPVAGLLSSRDFLGGLAFRVFHCTQYIRH

GSKPMYTPEPDICHELLGHVPLFSDRSFAQFSQEIGLASLGAPDEYIEKLATVSLHPVKV

THKINHHRVCSQIDFPFQIYWFTVEFGLCKQGDSIKAYGAGLLSSFGELQYCLSEKPKLL

PLELEKTAIQNYTVTEFQPLYYVAESFNDAKEKVRPLTKKGKNYPFASSFTYLTFARNFA

ATIPRPFSVRYDPYTQRIEVLDNTQQLKILADSINNIKAQSIAMGFNKFPIX

Augustus

Augustus a prédit 13 exons sur chacun des 2 transcrits.

Transcrit 1 :

Séquence protéique MSTAVLENPGLGRKLSDFGQETSYIEDNCNQNGAISLIFSLKEEVGALAKVLRLFEENDV

NLTHIESRPSRLKKDEYEFFTHLDKRSLPALTNIIKILRHDIGATVHELSRDKKKDTVPW

FPRTIQELDRFANQILSYGAELDADHPGFKDPVYRARRKQFADIAYNYRHGQPIPRVEYM

EEEKKTWGTVFKTLKSLYKTHACYEYNHIFPLLEKYCGFHEDNIPQLEDVSQFLQTCTGF

RLRPVAGLLSSRDFLGGLAFRVFHCTQYIRHGSKPMYTPEPDICHELLGHVPLFSDRSFA

QFSQEIGLASLGAPDEYIEKLATIYWFTVEFGLCKQGDSIKAYGAGLLSSFGELQYCLSE

KPKLLPLELEKTAIQNYTVTEFQPLYYVAESFNDAKEKVRNFAATIPRPFSVRYDPYTQR

IEVLDNTQQLKILADSINSEIGILCSALQKIK

Transcrit 2 :

Séquence protéique : MSTAVLENPGLGRKLSDFGQETSYIEDNCNQNGAISLIFSLKEEVGALAKVLRLFEENDV

NLTHIESRPSRLKKDEYEFFTHLDKRSLPALTNIIKILRHDIGATVHELSRDKKKDTVPW

FPRTIQELDRFANQILSYGAELDADHPGFKDPVYRARRKQFADIAYNYRHGQPIPRVEYM

EEEKKTWGTVFKTLKSLYKTHACYEYNHIFPLLEKYCGFHEDNIPQLEDVSQFLQTCTGF

RLRPVAGLLSSRDFLGGLAFRVFHCTQYIRHGSKPMYTPEPDICHELLGHVPLFSDRSFA

QFSQEIGLASLGAPDEYIEKLATVSLHPVKVTHKINHHRVCSQIDFPFQIYWFTVEFGLC

KQGDSIKAYGAGLLSSFGELQYCLSEKPKLLPLELEKTAIQNYTVTEFQPLYYVAESFND

AKEKVRNFAATIPRPFSVRYDPYTQRIEVLDNTQQLKILADSINSEIGILCSALQKIK

Format fasta : le format FASTA est un format basé sur du texte représentant des séquences

...

Télécharger au format  txt (6 Kb)   pdf (75.5 Kb)   docx (7.7 Kb)  
Voir 4 pages de plus »
Uniquement disponible sur DissertationsEnLigne.com