Transposons
Recherche de Documents : Transposons. Rechercher de 53 000+ Dissertation Gratuites et Mémoirestrotransposons à LTR tronqués les LINEs tronqués Les SINEs (= short interspersed repetitive elements)
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b) Des mécanismes de transposition différents :
Selon :
Les rétrotransposons à LTR :
Les ARN des rétrotransposons à LTR sont rétrotranscrits grâce à la transcriptase inverse dans le cytosol et les ADNc ainsi synthétisés sont adressés vers le noyau. L’intégrase permet alors l’insertion de ces ADNc dans le génome de l’hôte via des cassures double-brin.
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Les rétrotranposons sans LTR (= rétroposons)
Ils transposent via un mécanisme appelé rétrotranscription amorcée sur la cible (= target-primed reverse transcription).
Exemple des SINEs et des LINEs :
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I/ Les différents éléments transposables
•
La classe II : Les transposons à ADN
◦ Codent pour une transposase : enzyme de transposition. ◦ Certains se répliquent mais pas de déplacement autonome. ◦ Action de la transposase et d’autres enzymes. ◦ La plupart des transposons inactifs.
◦ 20 000 séquences = 3 % du génome humain. ◦ Contribution dans le génome = séquences codant pour les protéines 25 000 gènes = 2% du génome.
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• Exemple de transposons à ADN
◦ Les séquences d’insertion IS
700 à 2 500 pb Extrémités courtes répétées inversées ITR Séquence codant pour la transposase Peut contenir un gène de résistance aux antibiotiques
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• Action de la transposase
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II/ Les effets des E.T
• Transpositions et Régulations
Insertions
◦ Dans une phase codante, un intron, ou dans une zone régulatrice
Délétions
o
Même orientation
Inversions
o
Orientation opposée
Recombinaison
Translocation entre deux éléments homologues
o
a e a e f f
b g g
c
d h h
Régulation
◦ Les stress activent leur mobilité
b
c
d
◦ Stress biologique (ex : attaque de virus…)
◦ Stress abiotique (ex : sécheresse, blessures…) Etude réalisée chez l’orge
• Impacts bénéfiques
Etude sur le raisin
◦ Rétrotransposon Gret-1 responsable de la perte de pigmentation des raisins blancs.
Gret 1
VvmybA1a
5’ LTR
gag
pol
3’ LTR
VvmybA1
VvmybA1b
3’ LTR
VvmybA1
◦
Sources « Régulation de l'activité des éléments transposables », Cedric Moisy et al. Biofutur 260 Novembre 2005 « Retrotransposon-Induced Mutations in Grape Skin Color », Shozo Kobayashi et al, science vol 304, 14 Mai 2004
• Impacts bénéfiques
Etude sur la formation du placenta
◦ Peg10 joue un rôle dans le développement du placenta
Souris chimère Peg10 / Peg10
Souris normale Peg10 / Peg10
-
+
+
+
Souris « secourue » Peg10 / Peg10
Souris normale Peg10 / Peg10
-
+
+
+
Embryon non viable (placenta anormal)
Embryon viable (placenta normal)
Embryon viable normal)
(placenta
Embryon viable (placenta normal)
Peg10 paternel / Peg10 maternel
-
+
Peg10 / Peg10
+
+
Peg10 maternel / Peg10 paternel
-
+
Peg10 / Peg10
+
+
◦ Régulation particulière : l’empreinte génomique parentale ◦ Rôle exact à confirmer : Facteur de croissance ?
•
Impacts néfastes
Résistances aux ATB chez les bactéries problème de santé publique Les transposons semblent intervenir dans plusieurs maladies humaines ◦ Hémophilie A ◦ Cancer du poumon ◦ Cancer du colon ◦ Maladies neurologiques ◦ …
Etudes en cours
Conclusion
Transposons : éléments génétiques mobiles impliqués dans l’expression, la structure et la dynamique des génomes. o Rôle
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